Production de Pools d'ADN

production pools

La stratégie de pooling consiste à mélanger des clones bactériens afin de diminuer le nombre de réactions nécessaires au criblage d'une banque par PCR. Après mélange et transfert des clones en plaques par un automate de pipetage, l’ADN est extrait par lyse alcaline ou amplifié par une ADN polymérase « whole genome ». Les pools sont ensuite validés par le criblage de marqueurs PCR de référence.

Le CNRGV vous propose :

  • Des pools prêts à l’emploi de diverses banques génomiques : Tomate, Blé, Colza, Piment...
  • De réaliser « à façon » le pooling de vos banques.

 Selon la taille et les caratéristiques des banques concernées, nous vous proposons deux types de pools, en 2 ou 3 dimensions.

Pooling 2D

Le pooling en deux dimensions consiste à préparer des pools plaque (mélange des 384 échantillons d’une microplaque) puis à les mélanger selon une matrice 2 dimensions ("en colonne" et "en ligne"). Le criblage des pools ligne et colonne permet dans un premier temps de repérer les microplaques contenant les clones positifs. Pour chacune des plaques repérées, des pools secondaires ligne et colonne sont ensuite réalisés et criblés pour identifier les coordonnées du clone d'intérêt.

 

Pools 2D FR

 

Les pools 2D peuvent être produits rapidement pour un coût relativement limité, mais l’effort de criblage est plus lourd que pour d’autres stratégies de pooling (nécessité de criblage secondaire des plaques positives identifiées).

Pooling 3D

Le pooling en trois dimensions consiste à mélanger les clones d’un ensemble de plaques en lignes, colonnes et plaques entières. Le criblage de ces pools permet d’obtenir directement la coordonnée du clone positif.

 

Pools 3D FR

 

Ces pools 3D sont comparativement plus coûteux à mettre en œuvre que les pools 2D mais la quantité de matrice produite est ensuite quasiment illimitée et les criblages plus rapides à réaliser.

Contactez-nous pour plus d'informations sur les pools existants et vos projets spécifiques.

Pooling Strategy and Screening Service (PDF)

Équipement production de pools d'ADN

Les pools d’ADN sont produits par la station robotique à haut débit « Labstar-Hamilton». Sa programmation extrêmement flexible permet de proposer des stratégies de pooling à façon.

plaques 384
hamilton pools production
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