Criblage PCR de Pools

Le CNRGV vous propose :

• L’expédition d’ADN de pools vous permettant de réaliser vous-même vos criblages.
• La réalisation « à façon » de vos criblages : à partir de vos amorces nous effectuons les PCR sur les pools et l’analyse des résultats.

Les criblages sont réalisés par PCR en temps réel sur pools d'ADN extraits ou amplifiés par une enzyme polymerase "whole genome". Cette technique permet d'assurer un haut débit d'analyse, et une meilleure traçabilité des manipulations.

L’analyse des résultats d’amplification permet l’identification rapide des clones contenant les séquences recherchées. Nous vous fournissons les coordonnées des clones repérés après validation sur colonies isolées. Nous pouvons également vous fournir sur demande les clones identifiés.

Les pools de banques BAC disponibles à l'heure actuelle au laboratoire sont les suivants:

• Pools plaque : Colza (Darmor), Maïs..
• Pools 2D : Blé tendre (Chinese Spring, Renan), Blé dur, Tournesol,  piment (HD208)…
• Pools 3D : Blé tendre (Chinese Spring), Tomate (Heinz), Melon (PI161375), Canne à sucre…
• Pools 4D* : Tournesol (YDQ)

* Ces pools 4 dimensions ont été produits à l'INRA de Clermont Ferrand. Pour plus d'informations, veuillez-vous référer à l'article suivant : Bouzidi MF, Franchel J, Tao Q, Stormo K, Mraz A, Nicolas P, Mouzeyar S. A sunflower library suitable for PCR screening and physical mapping of targeted genomic regions. Theor Appl Genet 2006, 113:81-89

Pooling Strategy and Screening Service (PDF)

Équipement criblage de Pools

Les pools d’ADN sont criblés par PCR en temps réel en microplaque 384 puits. La PCR en temps réel permet une acquisition directe des résultats de criblage.