Vous souhaitez explorer la diversité génétique de loci d’intérêts au-delà des seules séquences codantes ? Notre workflow de capture ciblée TWIST permet d’analyser dans de grand panel de diversité les gènes d’intérêt ainsi que leurs régions flanquantes (jusqu’à ± 5 kb), offrant un panorama approfondi de la variabilité des séquences codantes et de leur contexte génomique.
La méthode repose sur le design de sondes spécifiques à partir d’une séquence de référence. Grace à ces sondes, les fragments d’ADN ciblés sont capturés puis séquencés, permettant la reconstruction précise des régions d’intérêt pour chaque génotype du panel. Nous avons mené plusieurs études pilotes dans le cadre de projets de recherche qui nous ont permis de démontrer la robustesse et l’efficacité de l’approche.
Chaque projet de capture présentant des objectifs et des contraintes spécifiques, il débute par une analyse de faisabilité. Notre équipe vous accompagne pour évaluer la région génomique ciblée, optimiser le design des sondes en lien étroit avec la société TWIST et définir le protocole expérimental le plus adapté. Lorsque les sondes sont définies, nous réalisons au laboratoire l’ensemble des étapes jusqu’à la production des séquences. Enfin, nous réalisons l’analyse bio-informatique des données pour assembler les régions génomiques d’intérêts.
Vous envisagez d’utiliser la technologie TWIST pour votre projet ?
Nous serons ravis d’échanger avec vous afin de comprendre vos besoins et d’évaluer la faisabilité de votre étude. N’hésitez pas à nous contacter pour plus d’informations.