TriticaeGenome : Vers la caractérisation du génome du blé et de l'orge
Seventh framework programmeFood Agriculture and Fisheries, Biotechnology
Coordinateur du projet
Dr. Catherine Feuillet
Institut National de la Recherche Agronomique-ASP
Domaine de Crouelle
234 Avenue du Brezet
63100 Clermont-Ferrand
France
www.clermont.inra.fr/umr-aspE-mail : catherine.feuillet@clermont.inra.fr
Résumé
Depuis de nombreuses années, la grandeur et la complexité des génomes du blé, de l'orge et du seigle ont ralenti le développement des approches génomiques et de leurs applications dans l’amélioration de la production et la qualité des récoltes. Cependant, récemment, de nouvelles approches technologiques plus efficaces ont été développées et de nouvelles ressources on été générées qui permettent que des programmes de génomiques robustes puissent être envisagés pour les Triticeae.
TriticeaeGenome est conçu pour accomplir des progrès significatifs dans la génomique des Triticeae et soutenir la reproduction efficace de variétés améliorées pour l'agriculture européenne. Ce projet sera développé par :
- La construction et l’ancrage des cartes physiques du blé et de l'orge pour les chromosomes 1 et 3 qui portent un grand nombre de caractères agronomiques importants (par ex. la résistance de maladie, la production et la qualité)
- L’isolement de gènes et QTLs liés à la résistance à des maladies, le rendement et les caractères de qualité pour le blé et l'orge
- L’identification et l’exploitation de nouveaux allèles pour les gènes isolés par l'utilisation de variants naturels et de populations mutées aussi bien que le germplasm sauvage
- Le développement de nouvelles variétés pour les besoins des consommateurs et des agriculteurs à travers des approches moléculaires
- Le développement de nouveaux outils bioinformatiques pour structurer, centraliser et analyser à grande échelle les données génomiques qui seront générées dans ce projet
- La mise en place de formation pour ces nouvelles approches technologiques, le partage des résultats et les transferts technologiques à l'industrie et aux collaborateurs internationaux.
Triticeaegenome est mis en place comme une contribution majeure aux efforts de consortiums internationaux dans le fait de construire des cartes physiques d'orge et de blé hexaploïde pour l’amélioration de l’agriculture, l'accélération de l'isolement de gènes et QTL et la mise en place de bases solides pour les prochains programmes de séquençage de ces génomes.
Triticeaegenome donnera des informations et des outils originaux aux éleveurs et aux scientifiques pour une meilleure compréhension de l'organisation des génomes des Triticeae, leur évolution et leur fonction, en fournissant une meilleure compréhension de la biologie de ces plantes cultivées essentielles.
liens utiles :
http://tritigen.ari.gov.cy/
http://www.wheatgenome.org/
http://urgi.versailles.inra.fr/Projects/TriticeaeGenome
Implications du CNRGV
Responsable : Arnaud Bellec/ Sonia Vautrin
- Conservation de banques BAC chromosome spécifique du blé.
- Rearrangement du Minimum Tilling Path
- Production de pools 3D sur les banques BACs chromosomes spécifiques Blé et sur la banque BAC Orge
Laboratoires partenaires
- Institut National de la Recherche Agronomique - INRA - France
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research - IPK - Germany
- Institute of Experimental Botany - IEB - Czech Republic
- GSF- National Research Center for Environment and Health - GSF - Germany
- Università degli Studi di Milano - UMIL - Italy
- University of Haifa - HU - Israel
- MTT (Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus) - MTT - Finland
- Scottish Crop Research Institute - SCRI - UK
- Sabanci University - SABA - Turkey
- National Institute of Agricultural Botany - NIAB - UK
- John Innes Centre - JIC - UK
- Universität Zürich - UZH - Switzerland
- INRA Transfert - IT - France
- Biogemma - BGA - France
- Lochow-Petkus GmbH - LP - Germany
- Istituto di Genomica Applicata - IGA - Italy
- University of Bologna -UNBO - Italy